Fue fundada por el canónigo Andrés de Madrigal en 1620. Destaca en ella una reja trazada por Francisco Hernández y obra de los hermanos Sánchez. Esta reja, muy similar a la de la Capilla de Santiago, posee el escudo de armas del fundador en la parte superior.
Capilla de San Andrés
Otro elemento destacado dentro de esta capilla es el retablo, obra de Pedro de Brizuela en el 1621. Éste esta compuesto por dos cuerpos, ático y tres calles. Todo es de madera tallada y entre sus figuras se encuentran las de San Pedro, San Pablo, San Lucas y San Juan, entre otros. Este retablo estaba concluido en 1623 y se doró en 1707
En su interior, se ha expuesto desde años atrás el Tríptico del Descendimiento, obra de Ambrosius Benson que realizó en 1530. Esta pintura formará parte de la nueva Sala de Pinturas Bajo Claustro, que se inaugura en el mes de diciembre de 2018.